Materials Studio是一套材料科学的仿真软件, MS是在化学和材料领域,为结构和计算器研究者所设计的专业仿真软件,提供用户流畅的操作接口,并包含完整的运算方法,让使用者容易上手并提供功能强大的仿真能力。
研究者通过MS提供的先进丰富多种算法进行综合分析计算,在性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟,通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。协助科学家解决重要问题,研发世界上最先进的材料。
XASUN当今世界唯一能提供塔式、机架、便携式、特种结构等规格,提供单路、双路、四路、八路最先进架构的高端图形工作站,XASUN紧随世界领先的intel和AMD的计算处理硬件主流技术, 和Nvidia和ATI高性能图卡以及一流的硬盘阵列技术,打造出具有超级性能的XASUN图形工作站和服务器,同时充分了解不同行业应用软件的计算特点,灵活方便的配置架构,使应用软件在任何一台支持基于Windows、Linux等主流操作系统的服务器或工作站上最高效率的进行运算,从而最大限度的发挥工作站硬件性能和网络资源。
分子模拟(材料计算)求解过程计算特点分析
主要集中在对CPU和内存方面,MS软件支持主流CPU的多核并行计算,在一个架构里,频率越高,核数,计算速度越快,内存方面主要体现在计算的规模上,随着对自然世界的深入了解和分析,分析精度越来越高,计算量也越来越大,对内存的要求也在不断递增,由于求解运算过程中大量时间都在计算中,对显卡的要求自然不高,图卡主要是后期对数据的可视化有些需求,另外MS软件运算特点是将数据一次性放到内存进行密集计算,自然对硬盘外设的读写不是很频繁,传统上SATA接口也足够了,如果内存不够,虚拟内存很大的话,推荐SAS硬盘,当然将来SSD便宜下来,内存和虚拟内存的比例1:2,可以考虑采用SSD硬盘
硬件配置关系注意事情:
1. 经过厂家推荐,目前12核不建议使用,8核Xeon架构效率更高
2. CPU—内存关系, 1核---对应配置---2G~4G, 8核处理器对应内存16GB~32GB.
3. 显卡要求不高,针对不同的计算规模,配置相应档次图卡,满足后期数据可视化需求。
4. 硬盘IO在计算过程中,影响不大,资金充足的话,视多种计算软件, SAS 6Gbps是目前相当不错的选择
XASUN图形工作站配置方案
MS软件配备丰富的应用功能模块,硬件如何配合好所有软件模块,非一般经验的硬件工程师所能了解的,今天我们对计算规模按原子数量初步划分,大致分三个档次:
1. 小规模计算工作站配置方案
定位:原子数不超过100个求解规模
推荐:4核Xeon 3470(2.93G)/16GB/Quadro600/1TB SATA
机器型号 XASUN T5 12912-T1AA
主要配置
4核Xeon 2.93/12GB/QadroFX3800/300G SAS
硬件配置明细
配件
品牌和型号
数量
CPU
4核Xeon X3470
1
2.93G/8MB/超线程/睿频
芯片组
intel S5520 Chips
1
内存
2G DDR3 1333 Reg ECC
6
显卡
Nvidia Quadro 600 1GB
1
系统盘
1TB SATA企业级
1
光驱
DVD刻录机
1
网卡
千兆以太端口
2
工作站平台
XASUN SSIEC105P7S (700W EPS)
1
显示器
优派23"专业显示器
1
噪音控制系统
静音级(全速计算45分贝以内)
硬件性能指标
CPU
运算速度每秒469亿次
GPU
几何三角形处理:2.1亿/秒,支持1*2
单屏幕,最高分辨率 2560*1600
几何三角形3亿/秒,像素填充率380亿/秒
支持32X全景反锯齿(FSAA)
支持30位色彩精度
1GB GDDR3显存
硬盘
IO读写带宽100MB/S,IOPS 200次/秒
网络端口
通过汇聚功能,实现2Gbps
硬件升级能力
CPU
支持Xeon3400全系列
显卡
支持Nvidai Quadro和ATI Firepro 系列
内存槽
6个,单根内存最大4GB,最大容量24GB
硬盘位
4个,单块最大SATA:2TB
PCI扩展
1*PCIE x8,2*PCIE x4,3*PCI-X
操作系统
支持Windows Server 2003、2008
支持Windows XP、Vista、7
支持Redhat、Suse Linux全系列
应用软件
基于windows、linux环境下软件全系列
报价
¥26,800元
2. 中大规模计算高端图形工作站配置方案
应用定位:原子数100~1000个之间求解规模
推荐:8核Xeon X5677(3.46G)/24GB/quadro2000/1TB SAS
如果从软件和硬件的价格对比,买一台配置最高的图形工作站,是最好的发挥软件性能的不二选择。
机器型号 XASUN T5 23524-A1AB
参考配置:
硬件配置明细
配件
品牌和型号
数量
CPU
4核Xeon X5677
2
3.46G/12MB/6.4GTs/超线程/Turbo
芯片组
intel S5520 Chips
1
内存
4G DDR3 1333 Reg ECC
6
显卡
Nvidia Quadro 2000 1GB
1
系统盘
1TB SAS 6Gbps
1
光驱
DVD刻录机
1
网卡
千兆以太端口
2
工作站平台
XASUN SDA6C105PAS (1000W EPS)
1
显示器
可选
噪音控制系统
静音级(全速计算45分贝以内)
硬件性能指标
CPU
运算速度每秒1107亿次
GPU
几何三角形处理:4.1亿/秒,
最高分辨率 2560*1600
192个流处理器, 1GB缓存,64X反锯齿
硬盘
IO读写带宽100MB/S,IOPS 200次/秒
网络端口
通过汇聚功能,实现2Gbps
硬件升级能力
CPU
支持Xeon5600全系列
显卡
支持Quadro FX全系列,支持双Quadro Plex
内存槽
12个,单根内存最大16GB,最大容量192GB
硬盘位
4个,单块最大SAS:1TB、SATA:2TB
PCI扩展
1*PCIE x8,2*PCIE x4,3*PCI-X
操作系统
支持Windows Server 2003、2008
支持Windows XP、Vista、7
支持Redhat、Suse Linux全系列
应用软件
基于windows、linux环境下软件全系列
报价
¥49,500元
3. 超大规模计算分布式集群服务器解决方案
定位: 原子数1000个以上求解规模
下面的方案主要是基于办公环境的计算应用,Xeon架构的计算机单机性能越来越强大,最新Xeon5600和单核时代的Xeon相比,快15倍以上,所以基于办公环境的小集群(40核以内),放在办公环境,计算性能满足大部分应用,同时也便于维护和使用。
22U高度(4U*5+1U+1U)
集群方案:
管理节点配置:8核Xeon E5605(2.13G)/8GB/600G SAS+ 4*1TBSATA
计算节点配置:8核Xeon E5640(2.66G)/24GB/500G SATA
计算节点数量:4个
硬件参考配置方案
1. 图形管理服务器(管理节点)
机器型号:XASUN R5 22724-T8ARC
主要配置
8核Xeon 2.4/24GB/Qadro4000/600G SAS+8TB阵列
硬件配置明细
配件
品牌和型号
数量
CPU
4核Xeon E5620
2
2.66G/12MB/6.4GTs/超线程/Turbo
芯片组
intel S5500 Chips
1
内存
4G DDR3 1333 Reg ECC
6
显卡
Nvidia Quadro 4000 2GB
1
系统盘
600G SAS 6Gbps
1
超级阵列
1TB SATA企业级
8
8port SAS2-RAID
1
光驱
DVD刻录机
1
网卡
千兆以太端口(可选万兆或IB卡)
2
工作站平台
XASUN SA6R416PAS (1000W EPS)
1
2 计算节点
机器型号 XASUN X5600 U22748AD
主要配置
8核Xeon 3.06/48GB/Qadro Fx5800+Gsync/300G SAS
硬件配置明细
配件
品牌和型号
数量
CPU
4核Xeon X5667
2
3.06G/12MB/6.4GTs/超线程/Turbo
芯片组
intel S5520 Chips
内存
4G DDR3 1333 Reg ECC
6
显卡
集成
1
系统盘
500G SATA
1
光驱
DVD
1
网卡
千兆以太端口
2
服务器平台
XASUN SA6U416PAS (1000W EPS)
1
3.服务器集群设备汇总表
NO
品牌和型号
数量
硬件配置明细
图形服务器集群
1.1
管理图形存储服务器
1
1.2
计算服务器(计算节点)
4
1.3
8口千兆交换机
1
1.4
8口 KVM切换器
1
1.5
22U机柜
1
可选设备
1.6
IB交换机
1
1.7
IB卡或万兆以太网卡
1
1.8
稳压电源(20KV)
1
1.9
集群硬件性能指标
CPU指标
浮点运算速度每秒3917亿次
海量存储
IO读写带宽700MB/S,IOPS 400次/秒
网络端口
通过汇聚功能,实现2Gbps
噪音控制系统
静音级(全速计算45分贝以内)
合计
¥1,800,000元
XASUN图形工作站简介
XASUN是当今市场唯一能提供塔式、机架、便携、特种服务器、工作站、图形服务器等全方面解决方案的品牌。
拥有完整、完美、可靠、静音的高性能计算机全套产品系列,为行业用户提供超级强劲性能的计算解决方案专业、高效的定制工作站配置方案。
materialstudio软件对CPU和内存要求较高。
配置在于CPU和内存,对显卡没要求,那么就可以按照这个思路去配电脑。
按照这个预算,CPU可以选择AMD的5950X,16核32线程,真正的性能怪兽,搭配B550或者X570主板,京东上套装价格6、7千,CPU散热器选个高端风冷就可以5、6百。